Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF1O43189 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF1O43189 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF1O43189 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF1O43189 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF1O43189 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF1O43189 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF1O43189 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF1O43189 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF1O43189 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF1O43189 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF1O43189 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF1O43189 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF1O43189 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF1O43189 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF1O43189 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF1O43189 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF1O43189 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF1O43189 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF1O43189 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF1O43189 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF1O43189 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF1O43189 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF1O43189 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF1O43189 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF1O43189 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF1O43189 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF1O43189 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF1O43189 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF1O43189 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF1O43189 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF1O43189 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF1O43189 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF1O43189 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF1O43189 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF1O43189 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF1O43189 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF1O43189 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF1O43189 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF1O43189 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF1O43189 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF1O43189 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF1O43189 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF1O43189 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF1O43189 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF1O43189 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF1O43189 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF1O43189 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF1O43189 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF1O43189 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF1O43189 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF1O43189 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF1O43189 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF1O43189 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF1O43189 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF1O43189 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF1O43189 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF1O43189 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF1O43189 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF1O43189 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF1O43189 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF1O43189 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF1O43189 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF1O43189 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF1O43189 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF1O43189 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF1O43189 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF1O43189 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF1O43189 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF1O43189 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF1O43189 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF1O43189 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF1O43189 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF1O43189 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF1O43189 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF1O43189 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF1O43189 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF1O43189 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PHF1O43189 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PHF1O43189 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PHF1O43189 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF1O43189 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF1O43189 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF1O43189 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF1O43189 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF1O43189 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF1O43189 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF1O43189 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF1O43189 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF1O43189 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF1O43189 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF1O43189 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF1O43189 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF1O43189 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF1O43189 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF1O43189 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF1O43189 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF1O43189 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF1O43189 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF1O43189 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms