Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM6AO15550 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms