Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VGFO15240 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VGFO15240 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VGFO15240 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VGFO15240 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VGFO15240 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VGFO15240 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VGFO15240 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VGFO15240 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VGFO15240 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VGFO15240 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VGFO15240 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VGFO15240 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VGFO15240 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VGFO15240 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VGFO15240 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VGFO15240 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VGFO15240 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VGFO15240 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VGFO15240 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VGFO15240 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VGFO15240 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
VGFO15240 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VGFO15240 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VGFO15240 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VGFO15240 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VGFO15240 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VGFO15240 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VGFO15240 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VGFO15240 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VGFO15240 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VGFO15240 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VGFO15240 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VGFO15240 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
VGFO15240 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
VGFO15240 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
VGFO15240 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
VGFO15240 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
VGFO15240 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
VGFO15240 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
VGFO15240 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
VGFO15240 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
VGFO15240 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
VGFO15240 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
VGFO15240 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
VGFO15240 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
VGFO15240 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
VGFO15240 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
VGFO15240 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
VGFO15240 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VGFO15240 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VGFO15240 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VGFO15240 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VGFO15240 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VGFO15240 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VGFO15240 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VGFO15240 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
VGFO15240 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VGFO15240 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
VGFO15240 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
VGFO15240 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VGFO15240 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VGFO15240 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VGFO15240 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VGFO15240 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VGFO15240 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VGFO15240 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VGFO15240 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VGFO15240 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VGFO15240 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VGFO15240 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VGFO15240 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VGFO15240 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VGFO15240 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VGFO15240 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VGFO15240 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VGFO15240 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VGFO15240 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VGFO15240 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VGFO15240 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VGFO15240 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VGFO15240 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VGFO15240 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VGFO15240 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VGFO15240 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VGFO15240 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VGFO15240 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VGFO15240 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
VGFO15240 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VGFO15240 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VGFO15240 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VGFO15240 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VGFO15240 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VGFO15240 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VGFO15240 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VGFO15240 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VGFO15240 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VGFO15240 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VGFO15240 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VGFO15240 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms