Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms