Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SETD1AO15047 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SETD1AO15047 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SETD1AO15047 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SETD1AO15047 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SETD1AO15047 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SETD1AO15047 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SETD1AO15047 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SETD1AO15047 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SETD1AO15047 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SETD1AO15047 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SETD1AO15047 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms