Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLGNO14967 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLGNO14967 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLGNO14967 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLGNO14967 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLGNO14967 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLGNO14967 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLGNO14967 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLGNO14967 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLGNO14967 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLGNO14967 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLGNO14967 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLGNO14967 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CLGNO14967 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLGNO14967 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLGNO14967 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLGNO14967 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLGNO14967 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLGNO14967 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CLGNO14967 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CLGNO14967 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLGNO14967 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLGNO14967 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLGNO14967 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CLGNO14967 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLGNO14967 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLGNO14967 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLGNO14967 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLGNO14967 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLGNO14967 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLGNO14967 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLGNO14967 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLGNO14967 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLGNO14967 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLGNO14967 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLGNO14967 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLGNO14967 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLGNO14967 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLGNO14967 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLGNO14967 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLGNO14967 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLGNO14967 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLGNO14967 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLGNO14967 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLGNO14967 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLGNO14967 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLGNO14967 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLGNO14967 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLGNO14967 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLGNO14967 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLGNO14967 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLGNO14967 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLGNO14967 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLGNO14967 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLGNO14967 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLGNO14967 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLGNO14967 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLGNO14967 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLGNO14967 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CLGNO14967 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLGNO14967 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLGNO14967 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLGNO14967 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLGNO14967 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLGNO14967 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLGNO14967 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLGNO14967 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLGNO14967 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLGNO14967 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLGNO14967 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLGNO14967 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLGNO14967 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLGNO14967 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLGNO14967 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLGNO14967 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLGNO14967 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLGNO14967 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLGNO14967 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLGNO14967 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLGNO14967 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLGNO14967 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLGNO14967 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CLGNO14967 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLGNO14967 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLGNO14967 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CLGNO14967 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLGNO14967 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CLGNO14967 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLGNO14967 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLGNO14967 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLGNO14967 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLGNO14967 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLGNO14967 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLGNO14967 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLGNO14967 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLGNO14967 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLGNO14967 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLGNO14967 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLGNO14967 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLGNO14967 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms