Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F3O00716 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F3O00716 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F3O00716 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F3O00716 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F3O00716 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F3O00716 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F3O00716 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F3O00716 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F3O00716 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F3O00716 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F3O00716 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F3O00716 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F3O00716 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
E2F3O00716 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
E2F3O00716 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
E2F3O00716 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
E2F3O00716 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F3O00716 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F3O00716 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F3O00716 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F3O00716 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F3O00716 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F3O00716 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F3O00716 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F3O00716 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F3O00716 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F3O00716 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F3O00716 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F3O00716 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F3O00716 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F3O00716 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F3O00716 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F3O00716 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F3O00716 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F3O00716 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F3O00716 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F3O00716 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F3O00716 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F3O00716 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F3O00716 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F3O00716 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F3O00716 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F3O00716 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F3O00716 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F3O00716 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F3O00716 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F3O00716 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F3O00716 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F3O00716 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F3O00716 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F3O00716 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F3O00716 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F3O00716 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F3O00716 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F3O00716 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F3O00716 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F3O00716 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F3O00716 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F3O00716 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F3O00716 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F3O00716 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F3O00716 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F3O00716 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F3O00716 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F3O00716 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F3O00716 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F3O00716 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F3O00716 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F3O00716 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F3O00716 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F3O00716 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F3O00716 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F3O00716 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F3O00716 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F3O00716 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F3O00716 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F3O00716 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F3O00716 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F3O00716 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F3O00716 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F3O00716 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F3O00716 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F3O00716 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F3O00716 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F3O00716 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F3O00716 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F3O00716 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F3O00716 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F3O00716 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F3O00716 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F3O00716 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F3O00716 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F3O00716 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F3O00716 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F3O00716 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F3O00716 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F3O00716 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F3O00716 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F3O00716 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms