Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms