Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms