Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms