Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STRCP1A6NGW2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
STRCP1A6NGW2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
STRCP1A6NGW2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STRCP1A6NGW2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STRCP1A6NGW2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STRCP1A6NGW2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
STRCP1A6NGW2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
STRCP1A6NGW2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STRCP1A6NGW2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
STRCP1A6NGW2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STRCP1A6NGW2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STRCP1A6NGW2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
STRCP1A6NGW2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
STRCP1A6NGW2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
STRCP1A6NGW2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
STRCP1A6NGW2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
STRCP1A6NGW2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
STRCP1A6NGW2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
STRCP1A6NGW2 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
STRCP1A6NGW2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
STRCP1A6NGW2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
STRCP1A6NGW2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
STRCP1A6NGW2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
STRCP1A6NGW2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
STRCP1A6NGW2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
STRCP1A6NGW2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
STRCP1A6NGW2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
STRCP1A6NGW2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms