Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms