Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms