Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms