Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms