Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC138207.8-204ENST00000579588 527 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 HTR1DP1-201ENST00000616500 888 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AL137847.1-201ENST00000416473 444 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms