Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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ECM1Q16610 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
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ECM1Q16610 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
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ECM1Q16610 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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ECM1Q16610 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
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