Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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