Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 C15orf41-202ENST00000437989 2240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TRHP20396 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TRHP20396 NLRP3-206ENST00000391828 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TRHP20396 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TRHP20396 LRRC31-202ENST00000316428 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TRHP20396 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TRHP20396 TGM4-201ENST00000296125 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TRHP20396 SPX-201ENST00000256969 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TRHP20396 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TRHP20396 HLTF-201ENST00000310053 5317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TRHP20396 CECR2-206ENST00000612582 9645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TRHP20396 KDM4C-205ENST00000428870 3039 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TRHP20396 RAD51AP2-201ENST00000399080 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRHP20396 IKZF3-215ENST00000535189 1996 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRHP20396 MS4A10-201ENST00000308287 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRHP20396 RIF1-205ENST00000444746 7897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRHP20396 ZNF441-201ENST00000357901 4356 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRHP20396 GON4L-219ENST00000622608 4801 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRHP20396 NEDD4L-203ENST00000357895 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRHP20396 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRHP20396 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TRHP20396 RN7SKP232-201ENST00000410170 290 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TRHP20396 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TRHP20396 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TRHP20396 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRHP20396 CCDC77-203ENST00000422000 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRHP20396 AL162427.1-201ENST00000450399 439 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRHP20396 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TRHP20396 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TRHP20396 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TRHP20396 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRHP20396 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TRHP20396 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRHP20396 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TRHP20396 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRHP20396 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRHP20396 AL845331.3-201ENST00000562821 2028 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRHP20396 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRHP20396 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TRHP20396 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TRHP20396 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TRHP20396 AL096816.1-201ENST00000623300 2920 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TRHP20396 TMPRSS4-AS1-204ENST00000636151 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRHP20396 ZMYND8-212ENST00000458360 3729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRHP20396 LRMP-204ENST00000547044 2208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRHP20396 ECT2-201ENST00000232458 4087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRHP20396 MAGEE1-201ENST00000361470 3630 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRHP20396 FCRL4-201ENST00000271532 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRHP20396 RTN3-202ENST00000339997 4886 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRHP20396 PIEZO2-201ENST00000302079 9356 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRHP20396 NUGGC-201ENST00000413272 3887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRHP20396 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRHP20396 KPNA6-201ENST00000373625 7378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRHP20396 ACO1-201ENST00000309951 7466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRHP20396 METTL8-217ENST00000612742 8132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRHP20396 SPATS2L-227ENST00000619961 6115 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRHP20396 MTURN-202ENST00000324489 5605 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRHP20396 CTNND1-234ENST00000532844 6012 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRHP20396 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRHP20396 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TRHP20396 CASP10-206ENST00000374650 1126 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRHP20396 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TRHP20396 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TRHP20396 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TRHP20396 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TRHP20396 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TRHP20396 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TRHP20396 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TRHP20396 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRHP20396 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRHP20396 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TRHP20396 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRHP20396 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TRHP20396 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TRHP20396 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TRHP20396 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRHP20396 AC092674.1-201ENST00000513871 571 ntTSL 4 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRHP20396 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRHP20396 AC022075.2-201ENST00000535911 562 ntTSL 4 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRHP20396 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRHP20396 MIR3680-2-201ENST00000578247 87 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TRHP20396 MIR3680-1-201ENST00000581433 87 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TRHP20396 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TRHP20396 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TRHP20396 AC133485.2-201ENST00000566232 2484 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRHP20396 NFIB-221ENST00000637742 2166 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRHP20396 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRHP20396 PTK2-207ENST00000517887 4661 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRHP20396 HUS1-201ENST00000258774 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRHP20396 HNRNPU-219ENST00000639628 4546 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRHP20396 CPNE8-201ENST00000331366 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRHP20396 AC135012.3-201ENST00000599841 4039 ntTSL 4 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRHP20396 TBC1D23-205ENST00000475134 2074 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRHP20396 MCM3-205ENST00000596288 3169 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRHP20396 KIDINS220-206ENST00000473731 7248 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
TRHP20396 LINC01304-204ENST00000454455 2454 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
TRHP20396 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
TRHP20396 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
TRHP20396 KIAA1217-201ENST00000307544 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
TRHP20396 RASGRP3-203ENST00000407811 4210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124 ms