Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 ZFP1-203ENST00000464850 3067 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 GABPB1-203ENST00000380877 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 DMBT1-201ENST00000330163 5802 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 DMBT1-206ENST00000368956 5802 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 EPB41L1-205ENST00000373946 6327 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ZFYVE26-207ENST00000555452 7309 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 AC012313.8-201ENST00000595059 5402 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ERG-201ENST00000288319 4919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ERG-206ENST00000398911 4914 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 PSAPL1-201ENST00000319098 4680 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 GDPD5-204ENST00000526177 4150 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 TMEM136-204ENST00000529187 3930 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 DIRAS1-201ENST00000323469 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 DSP-201ENST00000379802 9796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 TTTY2-201ENST00000417072 3168 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 TTTY2B-201ENST00000450591 3168 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 KCNE1B-202ENST00000618699 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 PISD-201ENST00000266095 2655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC02028-202ENST00000432154 2666 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 AL445471.2-201ENST00000568143 2443 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 EIF3D-201ENST00000216190 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 TTC39A-201ENST00000262675 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 LAMB1-204ENST00000393561 5766 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 AC079779.1-201ENST00000437798 4775 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 TMED7-201ENST00000456936 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM49B-215ENST00000519824 3798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ATP9B-201ENST00000307671 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 HMGCS1-201ENST00000325110 3506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 UIMC1-212ENST00000511320 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 CTAGE5-214ENST00000556148 2526 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 LRRC41-207ENST00000617190 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 MC1R-203ENST00000555427 3637 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ATG7-213ENST00000446450 2042 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 NUP85-211ENST00000579324 2010 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 AL359220.1-202ENST00000500036 4499 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 PIK3C2B-204ENST00000424712 7522 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 PIWIL2-205ENST00000611073 2864 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 RUBCNL-208ENST00000429979 3979 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 TGFB2-201ENST00000366929 5053 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 AC025279.1-201ENST00000604430 4818 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 USP29-201ENST00000254181 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 GPRASP2-201ENST00000332262 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 SSBP3-AS1-201ENST00000361350 2624 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 PIWIL2-204ENST00000521356 3488 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 POP1-201ENST00000349693 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 PAQR8-201ENST00000360726 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 EPS8L3-201ENST00000361852 2130 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5S12-201ENST00000362400 119 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5S11-201ENST00000362464 119 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5S3-201ENST00000362467 119 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5S1-201ENST00000362482 119 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5S5-201ENST00000362526 119 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5S10-201ENST00000363040 119 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5S8-201ENST00000363473 119 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5S17-201ENST00000363500 119 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5S4-201ENST00000363511 119 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5S6-201ENST00000363754 119 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP202-201ENST00000364315 119 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5S14-201ENST00000364485 119 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5S2-201ENST00000364718 119 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5S15-201ENST00000365055 119 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5S16-201ENST00000365387 119 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5S7-201ENST00000365651 119 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5S13-201ENST00000365656 119 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 AL031777.1-201ENST00000405418 499 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.3 ms