Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 RPL35P4-201ENST00000446039 322 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 RN7SL74P-201ENST00000464966 299 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 RN7SL63P-201ENST00000468228 304 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 RN7SL630P-201ENST00000483714 297 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AC009269.1-202ENST00000484381 469 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 GAPDHP31-201ENST00000509325 1014 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 TMEM269-202ENST00000536543 983 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 RN7SL670P-201ENST00000577235 294 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 ZNF675-204ENST00000599168 592 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AC009686.2-201ENST00000607017 577 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 MAGOHB-211ENST00000625272 319 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 C2orf83-204ENST00000641422 291 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 SYNE1-211ENST00000413186 4860 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 NGDN-201ENST00000397154 2204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 SLC28A2-201ENST00000347644 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 ERC1-213ENST00000543086 9241 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 PHF6-204ENST00000370803 4489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 BTBD3-214ENST00000618296 4582 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 ZNF827-203ENST00000508784 7463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 CD101-201ENST00000256652 3283 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 RIPOR2-205ENST00000510784 3381 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AL137782.1-201ENST00000563635 4128 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 LINC02245-201ENST00000449259 2928 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 HLTF-201ENST00000310053 5317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 TDRD9-201ENST00000339063 3447 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 NLRP14-201ENST00000299481 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 COPG1-201ENST00000314797 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 INTS12-202ENST00000394735 1927 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 ERCC8-201ENST00000265038 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 CPNE8-201ENST00000331366 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 NUP107-201ENST00000229179 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 SLC9B2-201ENST00000362026 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 CCDC149-204ENST00000504487 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 RPL12P38-202ENST00000588627 2319 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 CSMD1-206ENST00000520002 11740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 CSMD1-216ENST00000602557 11740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 ZNF317-201ENST00000247956 4073 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 LINC02517-201ENST00000509453 492 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AC091987.1-202ENST00000522464 789 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 IGLV7-35-201ENST00000523314 340 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AC099314.1-201ENST00000563916 562 ntTSL 4 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AC010139.1-201ENST00000596963 445 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AC093458.1-201ENST00000608912 222 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 GNAS-AS1_2.1-201ENST00000613404 114 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 TAF1A-201ENST00000350027 1966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 ZNF736-202ENST00000423484 7119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 RECQL-203ENST00000421138 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 MTTP-208ENST00000511045 3154 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 PIGA-201ENST00000333590 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 HPS4-201ENST00000336873 3786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 PIGP-202ENST00000360525 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 SHROOM4-203ENST00000460112 8919 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 LINC01359-204ENST00000447748 2804 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 WDR75-201ENST00000314761 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 TIAM2-208ENST00000461783 6981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 KAT14-206ENST00000489634 3152 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 NR3C2-207ENST00000511528 2967 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 SCYL3-202ENST00000367771 6364 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 MAP4K4-201ENST00000302217 6624 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 ADAM21P1-201ENST00000529267 2170 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 TRIM66-201ENST00000299550 9753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 PPIP5K2-202ENST00000358359 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AC114776.1-201ENST00000414159 4395 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 EIF4BP2-201ENST00000416702 1794 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 LDAH-201ENST00000237822 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 KIF21A-204ENST00000544797 5040 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 SCN11A-201ENST00000302328 6500 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 FAM168A-201ENST00000064778 7296 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 EFCAB7-201ENST00000371088 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 RN7SKP37-201ENST00000364494 296 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 S100A8-202ENST00000368733 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AP000812.1-201ENST00000378140 477 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 SNORD86-201ENST00000391196 86 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 RN7SKP152-201ENST00000410444 315 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AC009228.1-201ENST00000413254 240 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AL356309.1-201ENST00000425153 339 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms