Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AP005230.1-204ENST00000579097 779 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AC183089.2-201ENST00000637931 916 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 ZNF625-ZNF20-201ENST00000430024 2651 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 MPP7-201ENST00000337532 5080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 APOOL-203ENST00000622540 6466 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 XPO1-202ENST00000404992 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 MID1-202ENST00000380779 6044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 POC1B-AS1-201ENST00000605233 8041 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
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COL19A1Q14993 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
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COL19A1Q14993 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
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COL19A1Q14993 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
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COL19A1Q14993 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
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COL19A1Q14993 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
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COL19A1Q14993 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
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COL19A1Q14993 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 SEPT14-201ENST00000388975 3785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 PIGN-207ENST00000586566 3891 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 MITF-201ENST00000314557 1798 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 EPHA3-201ENST00000336596 5809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
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