Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8H2

KRTAP5-3, Keratin-associated protein 5-3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP5-3Q6L8H2 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 RBM17-205ENST00000446108 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 ZNF630-206ENST00000442455 2829 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 FGFR1-209ENST00000397113 3680 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 AL133325.3-201ENST00000622757 3674 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 KCNH5-204ENST00000420622 2711 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 PLEKHG5-203ENST00000377728 3613 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 AL138889.1-202ENST00000451317 3630 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 SLC12A4-204ENST00000541864 3627 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 ATP1A3-208ENST00000545399 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 ATP1A3-201ENST00000302102 3597 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 FOXL2NB-201ENST00000383165 3538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 SIRT5-204ENST00000397350 4382 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 CDC42SE2-208ENST00000505065 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 SCAMP5-201ENST00000361900 3427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 MYO15A-203ENST00000418233 3411 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 ACAA2-201ENST00000285093 3350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 MUC21-202ENST00000486149 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 CORO2B-202ENST00000540068 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 ACVRL1-206ENST00000550683 4121 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 SETD4-206ENST00000399212 3258 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 TTLL9-206ENST00000535842 3261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 PDGFD-201ENST00000302251 4052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 ZNF569-201ENST00000316950 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 ZSCAN30-201ENST00000333206 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 TMEM196-202ENST00000405844 4054 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 ASH2L-207ENST00000521652 2433 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 AC068580.4-203ENST00000636397 4038 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 MINK1-203ENST00000453408 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 TMEM87A-202ENST00000389834 3109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 SH3BGRL2-201ENST00000369838 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 PAK5-202ENST00000378423 4613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 LINC02052-202ENST00000427914 2285 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 CHRM3-207ENST00000615928 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 ICE2-213ENST00000561114 3796 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 DLG1-215ENST00000448528 2977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 LINC01498-201ENST00000502160 2984 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 RPS6KA5-202ENST00000536315 2993 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 POLR1E-201ENST00000377792 2229 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 TRAF3IP2-207ENST00000368761 5128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 NLRP3-205ENST00000391827 2940 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 VOPP1-208ENST00000433959 2900 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 ARHGAP30-201ENST00000368013 4394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 KLHL32-205ENST00000539200 3600 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 ASB7-201ENST00000332783 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 RSPH4A-201ENST00000229554 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 HTR1D-201ENST00000374619 2835 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 AC026124.1-201ENST00000545709 3457 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 NBR1-206ENST00000590996 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 ZNF155-209ENST00000611002 2732 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 EPHB6-201ENST00000411471 3367 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 OGDHL-203ENST00000432695 3383 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 SPIB-202ENST00000439922 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 CD86-201ENST00000264468 2634 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 ZNF300-201ENST00000274599 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 MARCH5-201ENST00000358935 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 ANKRD26P1-201ENST00000566201 3921 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 RSPH10B2-202ENST00000403107 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 RSPH10B-203ENST00000405415 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 198.9 ms