Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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CCDC142Q17RM4 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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CCDC142Q17RM4 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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CCDC142Q17RM4 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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CCDC142Q17RM4 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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CCDC142Q17RM4 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
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CCDC142Q17RM4 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
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CCDC142Q17RM4 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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