Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
MTMR3Q13615 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms