Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 ZNF880-203ENST00000424032 558 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 RAB7A-208ENST00000493186 329 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 AC211486.4-201ENST00000621495 113 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
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NFKB1P19838 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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NFKB1P19838 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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NFKB1P19838 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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NFKB1P19838 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 PA2G4P1-201ENST00000442248 1197 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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NFKB1P19838 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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NFKB1P19838 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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NFKB1P19838 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NFKB1P19838 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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