Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms