Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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SH3BP4Q9P0V3 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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SH3BP4Q9P0V3 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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SH3BP4Q9P0V3 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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SH3BP4Q9P0V3 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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SH3BP4Q9P0V3 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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SH3BP4Q9P0V3 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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SH3BP4Q9P0V3 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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