Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRIG3Q6UXM1 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms