Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
VPS72Q15906 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms