Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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