Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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CENPFP49454 PMCHL2-202ENST00000450213 1917 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CENPFP49454 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CENPFP49454 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CENPFP49454 PRRC2C-201ENST00000338920 10355 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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CENPFP49454 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CENPFP49454 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
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CENPFP49454 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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CENPFP49454 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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CENPFP49454 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CENPFP49454 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
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CENPFP49454 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CENPFP49454 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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CENPFP49454 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
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CENPFP49454 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
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CENPFP49454 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.69
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CENPFP49454 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CENPFP49454 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CENPFP49454 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CENPFP49454 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CENPFP49454 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CENPFP49454 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CENPFP49454 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CENPFP49454 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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