Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
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ECM1Q16610 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
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ECM1Q16610 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
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ECM1Q16610 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC6.77□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
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