Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 OR9A1P-202ENST00000484361 945 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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