Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms