Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC4A4Q9Y6R1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms