Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
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