Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
DCAF1Q9Y4B6 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.31■■■■□ 3.56
DCAF1Q9Y4B6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
DCAF1Q9Y4B6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
DCAF1Q9Y4B6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
DCAF1Q9Y4B6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
DCAF1Q9Y4B6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
DCAF1Q9Y4B6 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
DCAF1Q9Y4B6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
DCAF1Q9Y4B6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
DCAF1Q9Y4B6 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
DCAF1Q9Y4B6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
DCAF1Q9Y4B6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
DCAF1Q9Y4B6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
DCAF1Q9Y4B6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
DCAF1Q9Y4B6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
DCAF1Q9Y4B6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
DCAF1Q9Y4B6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
DCAF1Q9Y4B6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
DCAF1Q9Y4B6 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
DCAF1Q9Y4B6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
DCAF1Q9Y4B6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
DCAF1Q9Y4B6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
DCAF1Q9Y4B6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
DCAF1Q9Y4B6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
DCAF1Q9Y4B6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
DCAF1Q9Y4B6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC37.28■■■■□ 3.56
DCAF1Q9Y4B6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
DCAF1Q9Y4B6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
DCAF1Q9Y4B6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
DCAF1Q9Y4B6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
DCAF1Q9Y4B6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
DCAF1Q9Y4B6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
DCAF1Q9Y4B6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
DCAF1Q9Y4B6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
DCAF1Q9Y4B6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
DCAF1Q9Y4B6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
DCAF1Q9Y4B6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
DCAF1Q9Y4B6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
DCAF1Q9Y4B6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
DCAF1Q9Y4B6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
DCAF1Q9Y4B6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
DCAF1Q9Y4B6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
DCAF1Q9Y4B6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
DCAF1Q9Y4B6 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
DCAF1Q9Y4B6 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC37.26■■■■□ 3.56
DCAF1Q9Y4B6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
DCAF1Q9Y4B6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
DCAF1Q9Y4B6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
DCAF1Q9Y4B6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.24■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC37.24■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms