Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD3Q9Y3P4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms