Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E7

CHMP3, Charged multivesicular body protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP3Q9Y3E7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP3Q9Y3E7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP3Q9Y3E7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP3Q9Y3E7 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP3Q9Y3E7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP3Q9Y3E7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP3Q9Y3E7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP3Q9Y3E7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP3Q9Y3E7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP3Q9Y3E7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP3Q9Y3E7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP3Q9Y3E7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP3Q9Y3E7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP3Q9Y3E7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP3Q9Y3E7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP3Q9Y3E7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP3Q9Y3E7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP3Q9Y3E7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP3Q9Y3E7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 221.7 ms