Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

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Length 914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.32■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.31■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.31■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.31■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.31■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.3■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.3■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.3■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.3■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.3■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP20Q9Y2K6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
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