Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN37

VPS4A, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS4AQ9UN37 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS4AQ9UN37 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms