Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ2

SYNRG, Synergin gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNRGQ9UMZ2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNRGQ9UMZ2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNRGQ9UMZ2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNRGQ9UMZ2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNRGQ9UMZ2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNRGQ9UMZ2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNRGQ9UMZ2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNRGQ9UMZ2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNRGQ9UMZ2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNRGQ9UMZ2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNRGQ9UMZ2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNRGQ9UMZ2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNRGQ9UMZ2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNRGQ9UMZ2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNRGQ9UMZ2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNRGQ9UMZ2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNRGQ9UMZ2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNRGQ9UMZ2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNRGQ9UMZ2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNRGQ9UMZ2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNRGQ9UMZ2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNRGQ9UMZ2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNRGQ9UMZ2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNRGQ9UMZ2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNRGQ9UMZ2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNRGQ9UMZ2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNRGQ9UMZ2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNRGQ9UMZ2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNRGQ9UMZ2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNRGQ9UMZ2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNRGQ9UMZ2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNRGQ9UMZ2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNRGQ9UMZ2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNRGQ9UMZ2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNRGQ9UMZ2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNRGQ9UMZ2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNRGQ9UMZ2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNRGQ9UMZ2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNRGQ9UMZ2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNRGQ9UMZ2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNRGQ9UMZ2 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNRGQ9UMZ2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNRGQ9UMZ2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNRGQ9UMZ2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNRGQ9UMZ2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNRGQ9UMZ2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNRGQ9UMZ2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNRGQ9UMZ2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNRGQ9UMZ2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNRGQ9UMZ2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNRGQ9UMZ2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNRGQ9UMZ2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNRGQ9UMZ2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNRGQ9UMZ2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNRGQ9UMZ2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNRGQ9UMZ2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNRGQ9UMZ2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNRGQ9UMZ2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNRGQ9UMZ2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNRGQ9UMZ2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNRGQ9UMZ2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNRGQ9UMZ2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNRGQ9UMZ2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNRGQ9UMZ2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNRGQ9UMZ2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNRGQ9UMZ2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNRGQ9UMZ2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNRGQ9UMZ2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNRGQ9UMZ2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNRGQ9UMZ2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNRGQ9UMZ2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNRGQ9UMZ2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNRGQ9UMZ2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNRGQ9UMZ2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNRGQ9UMZ2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNRGQ9UMZ2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNRGQ9UMZ2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNRGQ9UMZ2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNRGQ9UMZ2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNRGQ9UMZ2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNRGQ9UMZ2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNRGQ9UMZ2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNRGQ9UMZ2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNRGQ9UMZ2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNRGQ9UMZ2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNRGQ9UMZ2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNRGQ9UMZ2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNRGQ9UMZ2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNRGQ9UMZ2 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNRGQ9UMZ2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNRGQ9UMZ2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNRGQ9UMZ2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNRGQ9UMZ2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNRGQ9UMZ2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNRGQ9UMZ2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNRGQ9UMZ2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNRGQ9UMZ2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNRGQ9UMZ2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNRGQ9UMZ2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNRGQ9UMZ2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms