Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PADI1Q9ULC6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms