Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD3Q9UJU5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms