Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ83

HACL1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACL1Q9UJ83 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HACL1Q9UJ83 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms