Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SFMBT1Q9UHJ3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SFMBT1Q9UHJ3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SFMBT1Q9UHJ3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SFMBT1Q9UHJ3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFMBT1Q9UHJ3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFMBT1Q9UHJ3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFMBT1Q9UHJ3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFMBT1Q9UHJ3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFMBT1Q9UHJ3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFMBT1Q9UHJ3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFMBT1Q9UHJ3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFMBT1Q9UHJ3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFMBT1Q9UHJ3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFMBT1Q9UHJ3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SFMBT1Q9UHJ3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SFMBT1Q9UHJ3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFMBT1Q9UHJ3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFMBT1Q9UHJ3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SFMBT1Q9UHJ3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFMBT1Q9UHJ3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SFMBT1Q9UHJ3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFMBT1Q9UHJ3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFMBT1Q9UHJ3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFMBT1Q9UHJ3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFMBT1Q9UHJ3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFMBT1Q9UHJ3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFMBT1Q9UHJ3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms