Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHF7

TRPS1, Zinc finger transcription factor Trps1, humanhuman

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1Q9UHF7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRPS1Q9UHF7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms