Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COPG2Q9UBF2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms