Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms